আমেনা বেগম ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের পদার্থবিজ্ঞান বিভাগ থেকে ১৯৭০ সালে স্নাতক ও স্নাতকোত্তর ডিগ্রি এবং ১৯৭৯ সালে যুক্তরাজ্যের এডিনবারা বিশ্ববিদ্যালয় থেকে নিউক্লিয় পদার্থবিজ্ঞানে পিএইচডি ডিগ্রি অর্জন করেন। তিনি বর্তমানে ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ে পদার্থবিজ্ঞান বিভাগে অধ্যাপক হিসাবে কর্মরত আছেন। ১৯৭৩ সাল থেকে বিশ্ববিদ্যালয় মঞ্জুরী কমিশনের কার্যক্রম শুরু হবার পর অধ্যাপক আমেনা বেগমই প্রথম মহিলা যিনি এর সদস্য হিসাবে দায়িত্ব (২০০৭-২০১১) পালন করেন। দেশে এবং বিদেশের জার্নালে অধ্যাপক আমেনা বেগমের পঁচিশটির অধিক গবেষণাপত্র প্রকাশিত হয়েছে।